More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3396 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
368 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  62.74 
 
 
366 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  59.13 
 
 
373 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  56.04 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  59.83 
 
 
366 aa  401  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  56.04 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  58.36 
 
 
379 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  54.52 
 
 
383 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  56.91 
 
 
375 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  56.25 
 
 
368 aa  362  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  49.58 
 
 
380 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  45.48 
 
 
373 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 
379 aa  289  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  49.12 
 
 
378 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 
367 aa  288  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  42.13 
 
 
368 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  45.89 
 
 
370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  45.91 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  47.32 
 
 
357 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  46.05 
 
 
379 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  42.98 
 
 
366 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  42.94 
 
 
366 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  45.1 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  43.66 
 
 
366 aa  268  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  44.03 
 
 
365 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  42.53 
 
 
366 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  44.63 
 
 
380 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  40.36 
 
 
368 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  39.13 
 
 
377 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  40 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  39.46 
 
 
377 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  38.16 
 
 
368 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  42.41 
 
 
371 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  38.99 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  38.38 
 
 
377 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  38.04 
 
 
379 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  37.8 
 
 
377 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  36.56 
 
 
382 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 
382 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  37.36 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  41.48 
 
 
383 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  36.68 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 
356 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
358 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
644 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 
372 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
352 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
364 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  31.81 
 
 
657 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.74 
 
 
378 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.74 
 
 
378 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
375 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
369 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 
378 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.71 
 
 
331 aa  92.8  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 
385 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
369 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  33.98 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 
376 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
377 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  40.35 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.73 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.42 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.14 
 
 
665 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.72 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.72 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  35.14 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  29.63 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.88 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.68 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>