More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 383 aa  751    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  57.99 
 
 		 373 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  55.65 
 
 		 372 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  56.99 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  56.44 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  54.52 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  56.2 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  53.56 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  52.46 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  51.85 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  53.68 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  43.66 
 
 		 369 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  43.38 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  41.94 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  44.51 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  43.85 
 
 		 379 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  43.77 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  43.82 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  43.68 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  43.84 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  43.53 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  41.32 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  38.16 
 
 		 368 aa  258  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  43.43 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  42.48 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  41.92 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  46.35 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  40.69 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  37.64 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  40.33 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  38.9 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  43.43 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  40.64 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  39.18 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  36.94 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  40.06 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  41.99 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  36.23 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  34.31 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 644 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  32.78 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  29.78 
 
 		 657 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.3 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.3 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 376 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 388 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.4 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  34.42 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.05 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  28.8 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.79 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.22 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.24 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.69 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.27 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  20.82 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  35.8 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.85 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>