More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3721 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
373 aa  740    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  76.84 
 
 
368 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  67.52 
 
 
379 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  58.36 
 
 
372 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  59.13 
 
 
368 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  57.37 
 
 
373 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  59.18 
 
 
366 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  56.44 
 
 
383 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  57.26 
 
 
366 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  56.08 
 
 
375 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  53.2 
 
 
380 aa  345  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  48.17 
 
 
369 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  48.18 
 
 
373 aa  292  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  44.82 
 
 
379 aa  282  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  46.59 
 
 
374 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  42.7 
 
 
368 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  49.01 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  42.78 
 
 
370 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  44.94 
 
 
366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  43.86 
 
 
366 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  38.16 
 
 
368 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  43.65 
 
 
367 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  43.48 
 
 
366 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  41.82 
 
 
388 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  43.82 
 
 
366 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  45.64 
 
 
378 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  43.15 
 
 
365 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  45.35 
 
 
379 aa  262  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  45.09 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  41.27 
 
 
368 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  40.71 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  39.73 
 
 
377 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  43.2 
 
 
371 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  39.5 
 
 
377 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 
377 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  38.81 
 
 
377 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  40.96 
 
 
382 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  45.2 
 
 
383 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 
382 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  36.61 
 
 
379 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  39.55 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  35.62 
 
 
391 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 
356 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
358 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 
644 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 
352 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
372 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
657 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
378 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.82 
 
 
378 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.82 
 
 
378 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
376 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
665 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 
377 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
383 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
383 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.51 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.81 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 
384 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  29.79 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.86 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.32 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  33.55 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  25.34 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>