More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0136 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 348 aa  700    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  23.55 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  27.94 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  21.07 
 
 		 345 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 311 aa  93.6  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  20.9 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.35 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.45 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  22.79 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  20.49 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  22.92 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  21.07 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  24.29 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  19.01 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  22.32 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  21.26 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  22.7 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  26.22 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  20.36 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  21.22 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  22.81 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  19.88 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.1 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  21.63 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  22.06 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  22.06 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.33 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  23.3 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  21.73 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  21.22 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  21.99 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  23.82 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.64 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  20.56 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  19.88 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  20.29 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  20 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  23.61 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  20.22 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  21.17 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  21.8 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  21.39 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  22.19 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  19.06 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  21.43 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  23.28 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  21.41 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  20.33 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  20.35 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  21.39 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  20.39 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  22.35 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  17.44 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  20.9 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  21.31 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  23.14 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  19.44 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  22.64 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  22.62 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.55 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.84 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  21.88 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  22.8 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  20.06 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  18.82 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  20.82 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  22.89 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  27.92 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  20.56 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  20.46 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>