More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0411 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  100 
 
 		 328 aa  671    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  39.53 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  30.12 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  32.53 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  29.25 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  29.07 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  23.55 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  30.89 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  26.61 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  25.8 
 
 		 322 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.52 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  25.85 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.09 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.32 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  28.71 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.22 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.32 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  24.79 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  24.79 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  24.79 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  23.37 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  25.28 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  24.51 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  24.51 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  21.97 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  25.23 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.4 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  24.14 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  24.14 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  27.12 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  27.33 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.48 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.64 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  24.64 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.81 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.05 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  23.71 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  25.43 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  27.36 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  23.78 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  21.23 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  20.52 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.32 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  22.35 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  29.69 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>