More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1579 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  75.77 
 
 		 326 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  31.97 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  27.41 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  27.25 
 
 		 345 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  27.41 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  30.23 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  28.73 
 
 		 301 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  29.39 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  25.23 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  28.02 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.56 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  23.61 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.72 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  27.38 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  22.82 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.86 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  22.86 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 375 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  28.09 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  24.36 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  23.36 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.06 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  20.67 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.37 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.74 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  22.13 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1026  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  22.34 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  21.22 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.46 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  21.97 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  23.71 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  26.8 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  21.54 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  22.03 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  22.78 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  25.76 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  22.68 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  26.29 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  23.84 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.62 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  20.52 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  20.59 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.21 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.51 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  22.56 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>