More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3103 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  100 
 
 		 326 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  75.77 
 
 		 326 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  36.29 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  32.49 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  29.25 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  25.97 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  31.15 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  29.8 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0379  hypothetical protein  30.94 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1519  hypothetical protein  30.36 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1230  flagellin modification protein PtmF  26.07 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  27.46 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  23.66 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.36 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  22.85 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  22.45 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.94 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.36 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  21.61 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.3 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.8 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  25.96 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.49 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.2 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.17 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  22.78 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  23.55 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.33 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  21.53 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.31 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  20.46 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  25.89 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  21.51 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1026  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.67 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  21.86 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  22.7 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  24.07 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  21.74 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  23.21 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  22.55 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  22.94 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  20.99 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  22.19 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  21.47 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  21.83 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  21.26 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  22.89 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  21.88 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.91 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.23 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  23.55 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  20.99 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>