233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0600 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0600  oxidoreductase-like  100 
 
 		 340 aa  701    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.476523  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0153  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000798784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  22.33 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  25.85 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3103  dehydrogenase  23.66 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1579  oxidoreductase-like protein  25.5 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.580893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  23.61 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0533  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.700366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  21.24 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  23.64 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  23.23 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01161  hypothetical protein  26.86 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2300  oxidoreductase family protein  26.14 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.995717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  23.15 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  21.43 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  23 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  21.6 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  22.91 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  29.86 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  20.39 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  22.52 
 
 		 667 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  21.56 
 
 		 667 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 381 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.9 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  22.43 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  23.94 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  24.2 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  23.31 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  24.02 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.15 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14141  hypothetical protein  23.47 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0733331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.22 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  21.6 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  22.22 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  21.43 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  23.77 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  22.99 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 		 404 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  20.26 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  32.71 
 
 		 302 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  19.67 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  22.71 
 
 		 399 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  22.27 
 
 		 358 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  19.83 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  20.8 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  21.97 
 
 		 403 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  20.8 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 680 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  20.11 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.07 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.9 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  22.68 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  22.87 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  24.49 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  20.51 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  20.35 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  21.01 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>