More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4270 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 363 aa  758    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  79.1 
 
 		 360 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  77.22 
 
 		 360 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  63.46 
 
 		 359 aa  481  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  55.62 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  54.44 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  56.55 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  56.02 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  54.44 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  56.02 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  56.62 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  56.82 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  53.82 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  50.28 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  27.95 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  38.06 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 337 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  38.06 
 
 		 337 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  27.39 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  28.38 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  27.9 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  29.57 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  27.04 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.33 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.83 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  27.56 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.95 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  28.02 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  26.41 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  29.35 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  26.2 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  27.75 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  35.65 
 
 		 695 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.66 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  28.42 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.1 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  25.68 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  24.65 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.23 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.13 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.9 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  24.47 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  27.54 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  32 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  24.47 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  24.47 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  24.47 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  24.47 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.37 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  23.98 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 699 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.02 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  30.41 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  26.67 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>