More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2957 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  700    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  70.69 
 
 		 356 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.26 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  70.98 
 
 		 356 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  72.33 
 
 		 352 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  71.18 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  71.18 
 
 		 352 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  71.18 
 
 		 353 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  72.27 
 
 		 337 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  70.8 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  51.56 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  50.42 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  50.28 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  54.13 
 
 		 359 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  35.43 
 
 		 715 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.92 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.65 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  37.4 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  32.74 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.11 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 		 719 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  34.22 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  31.3 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.63 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  36.49 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.39 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  34.97 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  29.82 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  22.35 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  27.86 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.18 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  24.73 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  32.54 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.41 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.19 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  28.21 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  25.14 
 
 		 438 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  29.26 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  26.41 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  23.27 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  22.64 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  25.25 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  29.61 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  30.81 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.75 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  30.21 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  21.43 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>