More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3884 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  100 
 
 		 312 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  78.21 
 
 		 319 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  77.56 
 
 		 319 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  77.56 
 
 		 319 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  75.72 
 
 		 318 aa  504  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  75 
 
 		 319 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  75.64 
 
 		 319 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  74.68 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  74.12 
 
 		 318 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  73.4 
 
 		 320 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  74.04 
 
 		 317 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  66.13 
 
 		 315 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  68.05 
 
 		 317 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  53.04 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  43.13 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.19 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 347 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.16 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 367 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  35.46 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.87 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.37 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  35.71 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  29.68 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  29.68 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.54 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.12 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.12 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.91 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.87 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.55 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  32.65 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.37 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.37 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.21 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.13 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.88 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  23.79 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  29.66 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.79 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>