More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0510 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  84.55 
 
 		 374 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 371 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  65.68 
 
 		 377 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  59.62 
 
 		 367 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  46.51 
 
 		 372 aa  358  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  45.7 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  40.64 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 400 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  30.02 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 468 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.79 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.79 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  38.84 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  32.34 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.33 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  32.53 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.7 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  23.04 
 
 		 464 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  32.89 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.97 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  36.03 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  23.12 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  23.12 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  37.32 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.8 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.3 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  37.5 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  27.43 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 667 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  24.05 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  31.74 
 
 		 435 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.77 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  31.97 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.69 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>