More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1467 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 381 aa  762    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  46.67 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  45.7 
 
 		 371 aa  333  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  45.45 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  46.74 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  45.07 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 399 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  30.4 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  29.57 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.14 
 
 		 495 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 459 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 459 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 467 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 		 459 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  27.75 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  34.08 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  22.33 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.92 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.28 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  23.64 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  38.14 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.14 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  39.56 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  21.88 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  23.51 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  28.79 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  33.9 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  39.13 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 468 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  37.76 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  32.1 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.79 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  23.2 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  35.96 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  31.06 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.88 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  35.2 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.26 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  46.77 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  24.19 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.06 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  31.48 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  30.57 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  32.48 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  39.44 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  40.32 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  35.51 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2041  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.284403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>