More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0808 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
367 aa  744    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  59.62 
 
 
371 aa  451  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  60.76 
 
 
374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  51.64 
 
 
372 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  53.97 
 
 
377 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 
381 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  42.63 
 
 
377 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
407 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 
400 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 
400 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
435 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
431 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  28.99 
 
 
430 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  27.05 
 
 
471 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
459 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
459 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
667 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 
369 aa  92.8  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 
363 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
364 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.46 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  23.76 
 
 
459 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  23.82 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  38.57 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  23.82 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  38.1 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 
464 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  30.98 
 
 
387 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
347 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.69 
 
 
495 aa  86.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 
381 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  34.72 
 
 
358 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.87 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  22.87 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.87 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  22.68 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 
485 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.05 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  38.21 
 
 
344 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  23.31 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.73 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  30.46 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  32.65 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  36.99 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  36.07 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  30.06 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 
473 aa  79.7  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  36.47 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  33.14 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>