More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0664 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
495 aa  1035    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  60.68 
 
 
474 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  47.37 
 
 
482 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  47.96 
 
 
461 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  49.05 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  47.47 
 
 
467 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  39.78 
 
 
456 aa  349  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  40.77 
 
 
467 aa  345  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.38 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  41.41 
 
 
459 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 
459 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  41.27 
 
 
459 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  40.42 
 
 
459 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  39.57 
 
 
459 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  40.42 
 
 
459 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  40.19 
 
 
459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  40.19 
 
 
459 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.89 
 
 
455 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  36.19 
 
 
471 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  39.91 
 
 
456 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  39.68 
 
 
456 aa  316  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  39.68 
 
 
456 aa  315  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  37.14 
 
 
473 aa  290  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 
481 aa  272  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  33.02 
 
 
435 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 
449 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 
464 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
451 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
381 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
397 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  26.86 
 
 
397 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 
367 aa  87  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  21.62 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  26.01 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
460 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
356 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
384 aa  64.3  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
366 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
335 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 
377 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  32.26 
 
 
350 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  33.06 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
478 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 
360 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
328 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 
360 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
326 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
390 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
377 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 
336 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.82 
 
 
343 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
345 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 
440 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  21.08 
 
 
435 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
387 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0755  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  32.26 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.82 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.41 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  19.81 
 
 
396 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.82 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
377 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  22.42 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
357 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  29.03 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.37 
 
 
343 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 
369 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
341 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
343 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.37 
 
 
343 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 
359 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 
357 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>