More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  975    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.7 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  43.36 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  43.36 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  42.7 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  42.92 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  42.48 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  42.04 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  42.48 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  42.48 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  40.09 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  40.88 
 
 		 456 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  42 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.69 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  37.77 
 
 		 482 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  36.42 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  37.18 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 474 aa  323  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.69 
 
 		 495 aa  319  6e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  37.79 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  37.07 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  36.98 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.9 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  22.29 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  26.96 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.29 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  27.95 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  22.75 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  39.68 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.87 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  34.43 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 345 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 345 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>