287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3812 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
451 aa  943    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  54.59 
 
 
458 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  54.55 
 
 
449 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  55.08 
 
 
435 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  52.17 
 
 
464 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 
456 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.53 
 
 
459 aa  295  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 
459 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.8 
 
 
455 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 
459 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  36.9 
 
 
459 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 
459 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 
459 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 
459 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  36.24 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 
459 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  35.08 
 
 
456 aa  279  9e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  35.08 
 
 
456 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  35.08 
 
 
456 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
467 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  35.85 
 
 
473 aa  249  8e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  33.19 
 
 
471 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  32.62 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  34.04 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
474 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  33.41 
 
 
474 aa  230  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
481 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.93 
 
 
495 aa  227  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.11 
 
 
397 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
403 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  23.31 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
406 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
462 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
455 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
459 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
501 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
449 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  35.56 
 
 
437 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
451 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
359 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2041  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
348 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.284403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
448 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
485 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
358 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
439 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
460 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
468 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
477 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
347 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  26 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  21.82 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
434 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 
341 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
452 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
340 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  27.54 
 
 
444 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
462 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 
356 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 
336 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
495 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
383 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
435 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
358 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
448 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 
471 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  29.77 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.75 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  23.49 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>