More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5867 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  100 
 
 		 397 aa  831    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.38 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.11 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 456 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.77 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  24.1 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  24.1 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  27.9 
 
 		 471 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 474 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  24.87 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.86 
 
 		 495 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  22.5 
 
 		 482 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  33.55 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  25.26 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.77 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.46 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.88 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  27.86 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.5 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.88 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.84 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  36.11 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32.29 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  27.45 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  38.95 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  29.47 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.27 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  23.9 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>