More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3794 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 377 aa  756    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  42.63 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  45.07 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  37.05 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  40.64 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  38.13 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  29.76 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.2 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  33.33 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  41.58 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  34 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  35.45 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  23.78 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  36.08 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  28.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.43 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.13 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.17 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.94 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  27.62 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.42 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  29.46 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  24.81 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.94 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  26.63 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  29.27 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.94 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  27.56 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  24.7 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.63 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  27.39 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  27.36 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>