More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3507 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  878    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  41.94 
 
 
439 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  43.15 
 
 
436 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  41.18 
 
 
421 aa  303  5.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  40.78 
 
 
428 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 
471 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 
469 aa  246  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  36.72 
 
 
464 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  38.23 
 
 
449 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
477 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 
451 aa  206  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
421 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 
432 aa  183  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
435 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
434 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
435 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
434 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
448 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
427 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.64 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
462 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
483 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
440 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 
462 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
476 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
435 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
485 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
444 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
447 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
447 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
501 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
459 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  33.95 
 
 
484 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  26.06 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 
444 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
499 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 
478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
445 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
468 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  33.43 
 
 
463 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
487 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
490 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 
451 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 
481 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
480 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 
459 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 
452 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 
403 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 
441 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 
473 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  23.54 
 
 
446 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.34 
 
 
458 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
356 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  35.77 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  35.77 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  21.27 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.12 
 
 
349 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.12 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.12 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 
355 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.71 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  28.84 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  32.4 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>