More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2673 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  70.64 
 
 		 421 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  79.38 
 
 		 424 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 423 aa  877    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 		 439 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  37.23 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  24.95 
 
 		 464 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  33.45 
 
 		 490 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 		 483 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 478 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.44 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.56 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 		 501 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  30.5 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 		 383 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  35.34 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  28.33 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  22.45 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.26 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  22.2 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.47 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  34.48 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  25.7 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>