More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4329 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
469 aa  972    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  49.24 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  45.94 
 
 
477 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  37.91 
 
 
436 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 
421 aa  266  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  35.42 
 
 
449 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  36.48 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
464 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  33.47 
 
 
451 aa  209  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 
428 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
462 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  31.5 
 
 
451 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 
435 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
427 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
435 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
436 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
432 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
458 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
448 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
440 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
424 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
434 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 
476 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  26.09 
 
 
437 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
435 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  34.05 
 
 
484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 
468 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
441 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
421 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 
444 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 
499 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
451 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 
480 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 
490 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 
473 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
457 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
485 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
452 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
487 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
445 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 
462 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
406 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
403 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
459 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 
501 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
483 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  26.8 
 
 
450 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  27.29 
 
 
444 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 
459 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  21.89 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.58 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.48 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.25 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  30.12 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  32.53 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.5 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  31.21 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  38.14 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2532  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
464 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
347 aa  67  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  30.36 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
412 aa  67  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
458 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>