More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3139 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  91.54 
 
 
495 aa  818    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
470 aa  952    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  61.77 
 
 
493 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  58.19 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  59.47 
 
 
450 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  55.43 
 
 
474 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  55.18 
 
 
467 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  51.47 
 
 
452 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  48.05 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  47.83 
 
 
444 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  43.75 
 
 
431 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  43.62 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  42.33 
 
 
455 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  44.06 
 
 
427 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  42.27 
 
 
496 aa  326  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  42.37 
 
 
411 aa  300  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  39.32 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 
429 aa  269  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 
425 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  37.95 
 
 
425 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 
396 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  32.58 
 
 
390 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
390 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  33.95 
 
 
393 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 
699 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
359 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.86 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 
390 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.72 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
330 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  36.05 
 
 
405 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
330 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  28.96 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 
403 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
359 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
416 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 
390 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  23.69 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 
463 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.66 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.66 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  23.16 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
403 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.77 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  30.26 
 
 
334 aa  77  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  23.37 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.4 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.58 
 
 
339 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.11 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.09 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.52 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
680 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.52 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  28.1 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  32.03 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.2 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.46 
 
 
347 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.36 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>