More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0322 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
356 aa  737    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  36.39 
 
 
373 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 
369 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  32.96 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  28.42 
 
 
368 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  28.26 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
352 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 
351 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 
363 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
358 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 
355 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
359 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
359 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
362 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
353 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.57 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  30.19 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  28.74 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
362 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.94 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 
360 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
344 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  26.33 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  33.78 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  32.52 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  23.06 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  22.25 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  22.25 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  26.15 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  33.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  34.38 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  33.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
644 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  33.59 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.25 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  33.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  33.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  35.62 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.72 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  33.79 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  30.41 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  30.15 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  34.42 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  32.81 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  35.86 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  34.38 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>