More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4918 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  64.95 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  65.56 
 
 		 344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  63.64 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  50.33 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  43.98 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  39.16 
 
 		 370 aa  208  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  35.24 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  38.37 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  35.63 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  36.06 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  32.57 
 
 		 355 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  27.79 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.49 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  25 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  30.83 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  25.93 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  24.83 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.48 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  31.52 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  23.41 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  21.86 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  24.16 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.08 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  29.27 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.77 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  34.65 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.07 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  24.11 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  26.24 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  23.59 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  26.89 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.63 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.74 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  24.08 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.01 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  21.78 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  31.22 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  24.63 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>