More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1086 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 382 aa  774    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  77.13 
 
 		 381 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  68.52 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  70.37 
 
 		 384 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  71.97 
 
 		 380 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  65.27 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  65.61 
 
 		 386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  63.61 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  64.02 
 
 		 384 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  61.84 
 
 		 389 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  61.58 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  61.17 
 
 		 383 aa  485  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  64.66 
 
 		 388 aa  484  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  62.3 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  59.84 
 
 		 383 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  58.73 
 
 		 382 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  57.89 
 
 		 382 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  57.11 
 
 		 382 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  56.38 
 
 		 381 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  54.11 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  54.55 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  55.94 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  32.79 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.13 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.13 
 
 		 371 aa  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  34.59 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.5 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.92 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.58 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  29.03 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.14 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  25.07 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  30.41 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.7 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  21.68 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.7 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.44 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.98 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.22 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  28.13 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  32.08 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  25.62 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  28.48 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  31.82 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0520  oxidoreductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  22.82 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.71 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3615  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>