More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2881 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  788    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  68.77 
 
 
381 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  65.88 
 
 
383 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  66.4 
 
 
383 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  61.9 
 
 
382 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  61.11 
 
 
382 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  61.38 
 
 
382 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  61.56 
 
 
387 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  58.27 
 
 
386 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  57.33 
 
 
385 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  57.74 
 
 
384 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  60.58 
 
 
380 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  59.08 
 
 
384 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  58.18 
 
 
387 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  56.38 
 
 
384 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  54.55 
 
 
387 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  53.91 
 
 
387 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  55.94 
 
 
382 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  52.21 
 
 
389 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  55.91 
 
 
381 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  52.73 
 
 
389 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  54.03 
 
 
387 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  52.48 
 
 
388 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.33 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
396 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.9 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.73 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  25.56 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.65 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.26 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  24.56 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  24.65 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.23 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.62 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.62 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
344 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.38 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 
329 aa  60.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.17 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
344 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.17 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.88 
 
 
350 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  24.28 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 
382 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.52 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  25.31 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  25.31 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.86 
 
 
287 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
435 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  26.81 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>