More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1858 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 387 aa  808    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  88.89 
 
 		 387 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  69.97 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  70.23 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  66.58 
 
 		 382 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  62.79 
 
 		 383 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  62.44 
 
 		 383 aa  511  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  59.48 
 
 		 381 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  61.56 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  58.7 
 
 		 386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  56.59 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  55.32 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  56.28 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  54.81 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  56.81 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  54.71 
 
 		 384 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  57.85 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  56.88 
 
 		 381 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  56.07 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  52.32 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  53.65 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  31.28 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  31.84 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  25 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  27.98 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  25.11 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  21.61 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.18 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  24.79 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  23.88 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  27.85 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  30.81 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  23.67 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.74 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  23.51 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  25.78 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  25.82 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.78 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  24.31 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  25.78 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  25.78 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  25.78 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  25.78 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  30.41 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>