More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4342 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 382 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  97.12 
 
 		 382 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  89.01 
 
 		 382 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  69.97 
 
 		 387 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  66.4 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  65.87 
 
 		 383 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  66.15 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  62.6 
 
 		 381 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  61.38 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  61.23 
 
 		 380 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  59.63 
 
 		 385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  60.21 
 
 		 384 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  61.11 
 
 		 381 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  59.73 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  58.63 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  57.52 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  57.74 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  59.01 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  56.69 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  57.11 
 
 		 382 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  55.38 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  56.43 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  24.94 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.37 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.17 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  24.81 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  24.81 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  30.8 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.23 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  22.7 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  23.93 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  22.74 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.86 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.17 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.17 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.09 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.17 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.7 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.7 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  24.68 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  28.75 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  27.19 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  31.09 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.1 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.69 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>