More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2017 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
384 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  81.98 
 
 
384 aa  661    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  67.99 
 
 
384 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  64.3 
 
 
386 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  68.6 
 
 
380 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  70.37 
 
 
382 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  67.72 
 
 
381 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  64.08 
 
 
383 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  64.08 
 
 
387 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  62.6 
 
 
387 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  62.11 
 
 
389 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  62.11 
 
 
389 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  62.7 
 
 
383 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  62.83 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  56.69 
 
 
381 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  60.21 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  59.73 
 
 
382 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  59.73 
 
 
382 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  58.62 
 
 
382 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  59.08 
 
 
381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  57.52 
 
 
385 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  56.28 
 
 
387 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  55.56 
 
 
387 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
396 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  34.54 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
368 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 
369 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 
356 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 
327 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
376 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.24 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  32.64 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  26.19 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.07 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.75 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.85 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  34.9 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.92 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.52 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.52 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.98 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  30.34 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.94 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
367 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  30.31 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>