More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4013 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  97.12 
 
 
382 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
382 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  89.79 
 
 
382 aa  718    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  70.23 
 
 
387 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  66.93 
 
 
387 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  66.4 
 
 
383 aa  522  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  66.4 
 
 
383 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  61.8 
 
 
381 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  62.43 
 
 
386 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  60.96 
 
 
380 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  60.21 
 
 
384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  60.21 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  58.84 
 
 
385 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  61.38 
 
 
381 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  57.52 
 
 
389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  58.01 
 
 
389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  59.73 
 
 
384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  58.63 
 
 
384 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  57.89 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  57.74 
 
 
387 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  59.01 
 
 
387 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  54.86 
 
 
387 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  56.17 
 
 
388 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  24.43 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.78 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.6 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  24.8 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  24.8 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  22.99 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.48 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  24.71 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23.98 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.57 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  23.79 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  30.05 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  29.49 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  27.57 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.71 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.7 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  22.19 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.7 
 
 
287 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.62 
 
 
360 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.31 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.31 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  28.12 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.86 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  24.15 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>