More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4759 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 381 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  68.77 
 
 		 381 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  63.78 
 
 		 383 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  64.57 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  62.86 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  62.6 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  61.8 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  58.64 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  59.84 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  62.6 
 
 		 380 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  59.48 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  57.74 
 
 		 384 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  58.53 
 
 		 381 aa  458  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  57.71 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  56.69 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  57.14 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  56.92 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  56.38 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  55.87 
 
 		 389 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  54.03 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  55.91 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  56.54 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  52.22 
 
 		 388 aa  381  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.58 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  23.58 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  22.75 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.6 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  21.84 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  25.1 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.38 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  24.67 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  23.16 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  24.31 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  23.79 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  25.99 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  22.58 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  23.61 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  25.86 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  26.94 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.22 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  26.3 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  25.65 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.49 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.43 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.49 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  23.89 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  23.79 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.49 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.48 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.67 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>