More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2855 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  89.53 
 
 		 383 aa  721    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  785    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  66.4 
 
 		 382 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  64.57 
 
 		 381 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4013  oxidoreductase domain protein  66.4 
 
 		 382 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 		 382 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  62.3 
 
 		 386 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  66.4 
 
 		 381 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  62.79 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  62.04 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  63.16 
 
 		 380 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  62.7 
 
 		 384 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  60.05 
 
 		 384 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  61.24 
 
 		 387 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  58.42 
 
 		 384 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  57.4 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4009  oxidoreductase domain protein  60.63 
 
 		 381 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  58.07 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1086  oxidoreductase domain protein  59.84 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  57.92 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  56.4 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  57.62 
 
 		 387 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  55.21 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.03 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.36 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  25.59 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.77 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  31.86 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.36 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.35 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.41 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  22.51 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.04 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.18 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  26.73 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.73 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  23.24 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  28.87 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0507  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>