More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1146 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
365 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  61.88 
 
 
364 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  54.9 
 
 
370 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  49.44 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  45.7 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 
344 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  39.05 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  37.57 
 
 
346 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  41.92 
 
 
349 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  38.37 
 
 
330 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 
341 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  27.75 
 
 
345 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.29 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  24.72 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  25.55 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.01 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.5 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.35 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.81 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  24.39 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.45 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.87 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  28.73 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
431 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  30.05 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
431 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.3 
 
 
357 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  23.45 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  24.5 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  31.5 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 
363 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  31.47 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  25.16 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  31.47 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  31.47 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  30.8 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  31.47 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  27.27 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.67 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  24.7 
 
 
330 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
318 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  36.57 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  30.96 
 
 
351 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.8 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  23.1 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.53 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 
343 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.8 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
380 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15440  predicted dehydrogenase  29.57 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  27.71 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.57 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  23.97 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.29 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  26.76 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.01 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>