More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27070 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  783    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  45.95 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  43.63 
 
 		 364 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  45.7 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  41.06 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  36.26 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  35.63 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  36.06 
 
 		 330 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  25.51 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  27.55 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.86 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.99 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  29.11 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  25.31 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.04 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.69 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  28.34 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  25.55 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  36.96 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  31.98 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  24.92 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  37.14 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  27.95 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  24.77 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  30.5 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  24.77 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.64 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  22.54 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  29.6 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.98 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  29.41 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.3 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.91 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  29.76 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  24.53 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  29.27 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  22.99 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  29.15 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  29.29 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  22.97 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  27.36 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  26.83 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  27.86 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  25.07 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  28.79 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  22.51 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.05 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  22.51 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  25.09 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.16 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  26.87 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  23.58 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  25.59 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  24.71 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.21 
 
 		 338 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>