More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3469 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 370 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  59.33 
 
 		 364 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  54.9 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  51.42 
 
 		 380 aa  335  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  45.95 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  39.17 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  41.69 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  36.13 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  39.16 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  31.43 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.34 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  26.72 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.96 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.25 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.21 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.03 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.73 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  33.86 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  25.36 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  25.89 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  37.34 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  32.98 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.66 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  22.44 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  30.41 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  25.75 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.99 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  26.35 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.24 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.12 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.06 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  37.29 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  32.02 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.6 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  36.04 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  29.68 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.14 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4191  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>