More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3840 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 321 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  61.95 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 350 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.85 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.95 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.63 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  36.5 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.61 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  31.94 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.76 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.43 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  34.9 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  29.01 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.35 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.34 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  33.58 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  31.73 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  29.63 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  30.33 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  32.94 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.3 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  32.94 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  38.13 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  32.94 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  32.42 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25.24 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.12 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.97 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  31.25 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  28.57 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  29.86 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  34.6 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.86 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  34.56 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  32.55 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>