More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4782 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  92.21 
 
 		 308 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  50.98 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  53.11 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  52.15 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  51.3 
 
 		 308 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  51.15 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  51.15 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  52.48 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  52.48 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  52.48 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  52.13 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  51.79 
 
 		 309 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  51.48 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  51.76 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  47.73 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  47.4 
 
 		 308 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  47.4 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  50.33 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  48.69 
 
 		 312 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  47.73 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  50.16 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  46.56 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  44.74 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  48.85 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  52.12 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  45.25 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  45.25 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  44.44 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  46.56 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  41.75 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  34.43 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  31.16 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  32.37 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  32.37 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  32.37 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  25.13 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  36.8 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  33.57 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  26.67 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.95 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  27.41 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.65 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  27.78 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  34.33 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.94 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.61 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.08 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.94 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.08 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  29.47 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.13 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3425  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.21 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  22.3 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  33.7 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4046  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.131768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.47 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  32.41 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.55 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  32.69 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  32.69 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  32.69 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>