More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0843 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  60.46 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  55.92 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  56.25 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  55.26 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  57.52 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  56.07 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  56.03 
 
 		 308 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  53.38 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  55.59 
 
 		 309 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  55.78 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  55.78 
 
 		 309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  55.78 
 
 		 309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  55.12 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  55.12 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  55.3 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  55.59 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  54.61 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  54.61 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  54.97 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  51.77 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  52.72 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  51.77 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  55.92 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  54.13 
 
 		 312 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  54.15 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  49.84 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  44.74 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  45.07 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  50.17 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  42.33 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.02 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  29.27 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  32.03 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  32.03 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  31.37 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  31.37 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  30.72 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  36.15 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  27.89 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  26.73 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  38.37 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.45 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  31.5 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.45 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.72 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.41 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  29.41 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.11 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  29.41 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.45 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  29.41 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.45 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.45 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  29.41 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  29.41 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.49 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  28.76 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  28.76 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  22.1 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  25.69 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  29.41 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  22.67 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  25.12 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>