More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1256 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
357 aa  705    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  61.86 
 
 
376 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  59.72 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1660  oxidoreductase domain-containing protein  57.81 
 
 
364 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  51.82 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 
369 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2066  oxidoreductase-like  34.81 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  36.69 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 
374 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 
355 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
347 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
369 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
383 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
366 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  33.92 
 
 
356 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
359 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
359 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 
359 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.93 
 
 
366 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
359 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
340 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.93 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.18 
 
 
358 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  33.16 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 
342 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.17 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  28.95 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.67 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.75 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  31.46 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.92 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  28.33 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  28.33 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  28.33 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  34.43 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  28.06 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  32.78 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.94 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.94 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.92 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  32.55 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.47 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.47 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  31.56 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.14 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.05 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  24.82 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  23.89 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.53 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.37 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.95 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  30.48 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  26.98 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  32.84 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>