More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1629 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  100 
 
 
309 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  81.23 
 
 
309 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  81.55 
 
 
309 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  81.88 
 
 
309 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  81.55 
 
 
309 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  81.55 
 
 
309 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  81.55 
 
 
309 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  80.26 
 
 
309 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  70.78 
 
 
309 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  64.57 
 
 
312 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  62.79 
 
 
312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  57.1 
 
 
308 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  57.43 
 
 
308 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  60.13 
 
 
310 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  58.5 
 
 
308 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  59.6 
 
 
323 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  57.24 
 
 
308 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  56.03 
 
 
311 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  54.97 
 
 
308 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  56.48 
 
 
341 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  56.48 
 
 
311 aa  328  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  54.97 
 
 
310 aa  328  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  57.19 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  57.98 
 
 
308 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  52.49 
 
 
308 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  51.79 
 
 
308 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  53.16 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  49.83 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 
313 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  51.97 
 
 
303 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  43.28 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.57 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  30.23 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  30.23 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  30.23 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  30.23 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.99 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  32.54 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  30.95 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  29.65 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
359 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
359 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  28.49 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  34.38 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 
359 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  38.71 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
353 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  36.13 
 
 
350 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
346 aa  62.4  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  42.34 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  32.54 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.22 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  31.88 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  37.5 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  27.18 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  39.02 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
370 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  38.3 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  32.5 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 
325 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
377 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  37.82 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 
367 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
377 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  33.61 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  25.38 
 
 
377 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  38.46 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  29.82 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  48.61 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  35.54 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.6 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>