More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4632 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  63.04 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  60.98 
 
 		 308 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  58.06 
 
 		 310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  56.13 
 
 		 341 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  56.13 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  53.77 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  53.8 
 
 		 308 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  60.73 
 
 		 308 aa  328  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  57.47 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  55.52 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  57.28 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  55.88 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  52.48 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  56.96 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  56.96 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  56.25 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  55.92 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  52.12 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  52.79 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  55.74 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  58.31 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  51.16 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  51.96 
 
 		 308 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  53.09 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  49.52 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  50.17 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  53.47 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  50.97 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  54.43 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  43.14 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  36 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  31.51 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.14 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  31.16 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.44 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  36 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  32.68 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.18 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  36.43 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  36.92 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  37.7 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  36.15 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  29.07 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  36.59 
 
 		 400 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  29.56 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.13 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.13 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  36.92 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.49 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  36.11 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  36.02 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.49 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  32.16 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.35 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.13 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.13 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.13 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  27.55 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>