More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 400 aa  792    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  60.05 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  53.24 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  50.66 
 
 		 385 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  46.32 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  44.53 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  47.37 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  44.25 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  31.17 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 412 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 359 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.87 
 
 		 331 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  37.78 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  28.29 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.19 
 
 		 339 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 350 aa  96.3  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.8 
 
 		 342 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.42 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  22.99 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.17 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.6 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.73 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.1 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.01 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  26.92 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  24.56 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  21.53 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  28.81 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  28.62 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.28 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.38 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  30.47 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  32.21 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  35.94 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.17 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  25.09 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>