More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0614 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  100 
 
 
317 aa  655    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  69.87 
 
 
312 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  67.83 
 
 
327 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  68.15 
 
 
315 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  68.89 
 
 
315 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  68.89 
 
 
318 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  62.67 
 
 
318 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  57.19 
 
 
318 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  59.43 
 
 
316 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  57.14 
 
 
313 aa  347  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  59.49 
 
 
314 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  57.56 
 
 
318 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  54.81 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  53.97 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  55.7 
 
 
323 aa  331  9e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.37 
 
 
321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  51.41 
 
 
322 aa  322  4e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  52.36 
 
 
311 aa  322  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.78 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  30.5 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  25.09 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  59.26 
 
 
64 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.74 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.74 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.32 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.07 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.46 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
382 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 
385 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
366 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
378 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
427 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.64 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.64 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.44 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.64 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  29.01 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.01 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
347 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  29.01 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
381 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
470 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
495 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  29.01 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  29.01 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  25 
 
 
386 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
431 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 
353 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
393 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
377 aa  59.3  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  22.38 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 
390 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.24 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.86 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
353 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  21.97 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>