More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2972 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  100 
 
 		 314 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  76.42 
 
 		 318 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  72.93 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  60.32 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  59.24 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  61.02 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  60.57 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  59.37 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  59.49 
 
 		 317 aa  374  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  58.04 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  53.99 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  55.02 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  51.74 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  52.33 
 
 		 311 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  52.05 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  52.4 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  52.43 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.43 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  25.87 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  62.96 
 
 		 64 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.89 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.36 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.36 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  22.35 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 381 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.57 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  26.59 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  24.15 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  26.7 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  27.38 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  21.9 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.88 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  21.95 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  23.88 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.49 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  27.69 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 699 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.83 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>