More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0822 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  78.3 
 
 
318 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  72.93 
 
 
314 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  61.9 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  60 
 
 
318 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  61.2 
 
 
327 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  60.76 
 
 
315 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  60.58 
 
 
312 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  59.43 
 
 
317 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  58.93 
 
 
318 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  59.16 
 
 
323 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  56.55 
 
 
318 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  56.55 
 
 
313 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.52 
 
 
321 aa  361  8e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  55.27 
 
 
314 aa  358  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  56.42 
 
 
311 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  54.09 
 
 
322 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  54.52 
 
 
318 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.41 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.94 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  61.82 
 
 
64 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  27.67 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.5 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.43 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  26.21 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 
356 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  25.74 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.36 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
495 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  22.98 
 
 
474 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.25 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  24.38 
 
 
444 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
381 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 
399 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.13 
 
 
421 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
427 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 
386 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.5 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  28.85 
 
 
393 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.5 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 
366 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 
384 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
373 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  22.07 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 
381 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
395 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 
374 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>