More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3129 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  83.12 
 
 		 327 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  82.48 
 
 		 315 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  81.73 
 
 		 312 aa  534  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  74.13 
 
 		 318 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  68.89 
 
 		 317 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  63.32 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  61.9 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  60.32 
 
 		 314 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  57.64 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.59 
 
 		 323 aa  362  6e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  54.14 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  55.73 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  54.14 
 
 		 314 aa  348  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  54.66 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  49.84 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  49.17 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 		 342 aa  85.9  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  60.71 
 
 		 64 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  29.3 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  27.01 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.38 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.29 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.38 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.55 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.19 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.46 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  23.7 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 381 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  29.66 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.37 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.86 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.66 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  24.76 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.66 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.66 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.66 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  29.17 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.66 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  25.95 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  28.47 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  24.52 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  29.73 
 
 		 383 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 		 435 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 715 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.28 
 
 		 390 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 		 384 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.12 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>