More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0050 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
362 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
362 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  27.09 
 
 
358 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  23.25 
 
 
367 aa  116  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4378  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  23.82 
 
 
368 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  29.08 
 
 
355 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1833  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 
355 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  39.39 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  37.42 
 
 
338 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  36.57 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  36.36 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0257  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  38.1 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  37.4 
 
 
348 aa  85.9  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  37.78 
 
 
337 aa  85.9  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  40.15 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  29.96 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  38.76 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  39.69 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
342 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  38.69 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  36.51 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  29.26 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  29.26 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  29.26 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  38.89 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  40.77 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  36.43 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  33.14 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  33.14 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  31.65 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.97 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  34.88 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  34.19 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  39.06 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  36.15 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  35.29 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  37.12 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  34.11 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.18 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  36.72 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  37.74 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  33.11 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.48 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.53 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  34.39 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.48 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.16 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  32.06 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.81 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.77 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.77 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.77 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.77 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  33.76 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  35.88 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  31.71 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  28.64 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  36.84 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.01 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  32.82 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.04 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  29.71 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  34.09 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.219606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>