More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1510 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 318 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  62.74 
 
 		 313 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  60.7 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  58.1 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  58.01 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  59.24 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.89 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  55.52 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  54.14 
 
 		 315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  57.14 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  55.1 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  55.24 
 
 		 315 aa  351  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  55.1 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  56.55 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  54.81 
 
 		 317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  54.11 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  51.11 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  51.74 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  71.93 
 
 		 64 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  28.21 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  27.48 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  29.9 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  28.22 
 
 		 450 aa  65.9  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.06 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.24 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 470 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.9 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.17 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.19 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.77 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.44 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 390 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 495 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  23.19 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  29.79 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  27.18 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  30.22 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  23.29 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.93 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30.86 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.96 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  29.66 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>