More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0542 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
321 aa  662    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  72.15 
 
 
322 aa  497  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  62.94 
 
 
323 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  63.17 
 
 
318 aa  414  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  62.3 
 
 
313 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  53.65 
 
 
314 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  54.89 
 
 
318 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  57.14 
 
 
318 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  54.26 
 
 
327 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  53.63 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  53.44 
 
 
318 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  53.33 
 
 
312 aa  341  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  54.52 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  49.84 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  46.65 
 
 
311 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  52.37 
 
 
317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  51.43 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  29.03 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  58.93 
 
 
64 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.5 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  25.74 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
373 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  27.52 
 
 
390 aa  63.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  30.15 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  21.4 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  24.24 
 
 
450 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
350 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  21.67 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  23.2 
 
 
366 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
425 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 
425 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
467 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.22 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  22.63 
 
 
474 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
452 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 
374 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 
381 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  24.27 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
442 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  21.33 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  23.87 
 
 
496 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
390 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 
380 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
358 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  22.55 
 
 
375 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
365 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  25.15 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.97 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.97 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>